Шаг 1: стопорим mysql
service mysql-server stop
Шаг 2: создаем новое хранилище, копируем данные, ставим юзера и группу
mkdir /mysql cp -r /var/db/mysql /mysql chown -R mysql:mysql /mysql
Шаг 3: добавляем в /etc/rc.conf строчку
mysql_dbdir="/mysql"
Шаг 4: запускаемся
service mysql-server start
Если что-то идет не так идем смотреть лог ошибок в /mysql, файлик с рассширением .err